Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX1Q01196 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms