Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CSNK2A1P68400 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1206.3 ms