Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ITGAEP38570 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
ITGAEP38570 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ITGAEP38570 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ITGAEP38570 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ITGAEP38570 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGAEP38570 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms