Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2E1P29083 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms