Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1P21675 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1P21675 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1P21675 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TAF1P21675 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TAF1P21675 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TAF1P21675 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TAF1P21675 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TAF1P21675 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TAF1P21675 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1P21675 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1P21675 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1P21675 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1P21675 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1P21675 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF1P21675 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1P21675 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1P21675 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1P21675 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1P21675 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1P21675 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1P21675 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1P21675 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1P21675 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1P21675 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1P21675 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1P21675 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1P21675 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1P21675 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1P21675 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1P21675 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1P21675 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1P21675 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1P21675 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1P21675 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1P21675 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1P21675 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1P21675 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1P21675 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1P21675 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1P21675 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1P21675 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1P21675 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1P21675 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1P21675 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1P21675 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1P21675 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1P21675 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TAF1P21675 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TAF1P21675 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1P21675 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1P21675 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1P21675 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1P21675 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1P21675 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TAF1P21675 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms