Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTNP21246 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTNP21246 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTNP21246 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTNP21246 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTNP21246 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTNP21246 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTNP21246 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTNP21246 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTNP21246 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTNP21246 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTNP21246 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTNP21246 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTNP21246 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTNP21246 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTNP21246 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTNP21246 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTNP21246 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTNP21246 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTNP21246 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTNP21246 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTNP21246 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTNP21246 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTNP21246 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTNP21246 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTNP21246 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTNP21246 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTNP21246 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTNP21246 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms