Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMBSP08397 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMBSP08397 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBSP08397 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBSP08397 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBSP08397 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBSP08397 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBSP08397 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBSP08397 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBSP08397 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBSP08397 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBSP08397 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBSP08397 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBSP08397 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBSP08397 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBSP08397 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBSP08397 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBSP08397 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBSP08397 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBSP08397 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBSP08397 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBSP08397 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBSP08397 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBSP08397 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBSP08397 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBSP08397 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMBSP08397 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMBSP08397 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBSP08397 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBSP08397 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBSP08397 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms