Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB6O95452 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB6O95452 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB6O95452 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB6O95452 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB6O95452 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB6O95452 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB6O95452 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB6O95452 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB6O95452 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB6O95452 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB6O95452 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB6O95452 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB6O95452 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB6O95452 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB6O95452 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB6O95452 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB6O95452 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB6O95452 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB6O95452 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB6O95452 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB6O95452 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB6O95452 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB6O95452 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms