Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM4AO75164 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms