Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
N4BP1O75113 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
N4BP1O75113 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4BP1O75113 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms