Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN1O60635 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN1O60635 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN1O60635 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms