Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC7A4O43246 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms