Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV30A0A0K0K1B3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV30A0A0K0K1B3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV30A0A0K0K1B3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV30A0A0K0K1B3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV30A0A0K0K1B3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV30A0A0K0K1B3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV30A0A0K0K1B3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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TRBV30A0A0K0K1B3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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TRBV30A0A0K0K1B3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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TRBV30A0A0K0K1B3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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TRBV30A0A0K0K1B3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRBV30A0A0K0K1B3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TRBV30A0A0K0K1B3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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TRBV30A0A0K0K1B3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRBV30A0A0K0K1B3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV30A0A0K0K1B3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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