Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms