Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SETD1BQ9UPS6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SETD1BQ9UPS6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SETD1BQ9UPS6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms