Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHA12Q9UN75 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHA12Q9UN75 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms