Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C4Q9UKN8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF3C4Q9UKN8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C4Q9UKN8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms