Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEFF2Q9UIK5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms