Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRP68Q9UHB9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRP68Q9UHB9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRP68Q9UHB9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms