Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NECAP2Q9NVZ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms