Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BATF3Q9NR55 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BATF3Q9NR55 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms