Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS4Q9NQG7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms