Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDT1Q9H211 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDT1Q9H211 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDT1Q9H211 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms