Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D3AQ9BRG2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms