Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF1Q9BQI6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF1Q9BQI6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms