Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN7L3BQ96GX2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN7L3BQ96GX2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN7L3BQ96GX2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN7L3BQ96GX2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN7L3BQ96GX2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN7L3BQ96GX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN7L3BQ96GX2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3BQ96GX2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms