Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXNL1Q96CM4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXNL1Q96CM4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms