Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP2LQ8IYA6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP2LQ8IYA6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms