Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SKAP1Q86WV1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms