Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP13Q86W25 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP13Q86W25 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP13Q86W25 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP13Q86W25 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms