Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX30Q5VWJ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX30Q5VWJ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX30Q5VWJ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX30Q5VWJ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX30Q5VWJ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX30Q5VWJ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX30Q5VWJ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX30Q5VWJ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX30Q5VWJ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX30Q5VWJ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms