Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDHAF4Q5VUM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDHAF4Q5VUM1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms