Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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C9orf135Q5VTT2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf135Q5VTT2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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C9orf135Q5VTT2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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C9orf135Q5VTT2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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C9orf135Q5VTT2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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C9orf135Q5VTT2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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C9orf135Q5VTT2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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C9orf135Q5VTT2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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C9orf135Q5VTT2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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C9orf135Q5VTT2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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C9orf135Q5VTT2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
C9orf135Q5VTT2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf135Q5VTT2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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