Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B4Q15427 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 43.2
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SF3B4Q15427 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 43.2
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SF3B4Q15427 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 43.2
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SF3B4Q15427 NDRG2-240ENST00000555026 1162 ntTSL 59.78□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 43.2
SF3B4Q15427 NDRG2-250ENST00000556008 1051 ntTSL 59.4□□□□□ -0.92e-9■■■■■ 43.2
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