Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO2Q13137 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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CALCOCO2Q13137 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO2Q13137 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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