Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3AQ05086 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE3AQ05086 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 381.4 ms