Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE1BQ01064 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE1BQ01064 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.7 ms