Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SERPINF1P36955 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SERPINF1P36955 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SERPINF1P36955 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SERPINF1P36955 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SERPINF1P36955 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SERPINF1P36955 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SERPINF1P36955 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SERPINF1P36955 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SERPINF1P36955 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SERPINF1P36955 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms