Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTHFD1P11586 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MTHFD1P11586 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms