Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DMDP11532 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DMDP11532 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DMDP11532 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DMDP11532 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DMDP11532 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DMDP11532 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DMDP11532 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DMDP11532 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DMDP11532 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DMDP11532 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DMDP11532 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DMDP11532 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DMDP11532 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DMDP11532 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DMDP11532 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DMDP11532 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DMDP11532 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DMDP11532 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DMDP11532 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DMDP11532 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DMDP11532 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DMDP11532 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DMDP11532 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DMDP11532 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DMDP11532 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DMDP11532 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DMDP11532 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DMDP11532 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DMDP11532 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DMDP11532 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DMDP11532 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DMDP11532 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DMDP11532 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DMDP11532 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DMDP11532 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DMDP11532 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DMDP11532 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DMDP11532 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DMDP11532 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DMDP11532 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DMDP11532 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DMDP11532 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DMDP11532 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DMDP11532 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DMDP11532 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DMDP11532 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DMDP11532 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms