Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DOAP06340 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DOAP06340 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DOAP06340 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DOAP06340 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DOAP06340 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DOAP06340 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HLA-DOAP06340 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DOAP06340 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-DOAP06340 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms