Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF2P04141 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSF2P04141 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSF2P04141 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSF2P04141 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSF2P04141 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSF2P04141 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSF2P04141 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSF2P04141 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF2P04141 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF2P04141 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF2P04141 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF2P04141 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF2P04141 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSF2P04141 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSF2P04141 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSF2P04141 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSF2P04141 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms