Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIN3BO75182 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.1 ms