Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KDM4AO75164 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM4AO75164 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM4AO75164 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms