Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAD1O00515 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAD1O00515 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAD1O00515 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAD1O00515 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAD1O00515 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAD1O00515 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LAD1O00515 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAD1O00515 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAD1O00515 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAD1O00515 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAD1O00515 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAD1O00515 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAD1O00515 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAD1O00515 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAD1O00515 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LAD1O00515 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAD1O00515 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAD1O00515 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAD1O00515 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAD1O00515 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAD1O00515 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAD1O00515 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAD1O00515 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAD1O00515 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAD1O00515 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAD1O00515 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAD1O00515 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LAD1O00515 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAD1O00515 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAD1O00515 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAD1O00515 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAD1O00515 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAD1O00515 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAD1O00515 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAD1O00515 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAD1O00515 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAD1O00515 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAD1O00515 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAD1O00515 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAD1O00515 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAD1O00515 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAD1O00515 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms