Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMPRSS11EQ9UL52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS11EQ9UL52 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11EQ9UL52 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms