Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms