Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED17Q9NVC6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MED17Q9NVC6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED17Q9NVC6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 342.7 ms