Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPCDR1Q9BY65 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPCDR1Q9BY65 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms