Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RBM42Q9BTD8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms